Università degli Studi di Roma "Tor Vergata"

OBIETTIVI FORMATIVI: Fornire allo studente la conoscenza dei meccanimi molecolari alla base dell'ereditarietà e dei principi basilari della trasmissione genetica

OBIETTIVI FORMATIVI:
Il corso di Biochimica prevede di sviluppare le conoscenze dei processi biochimici che sottendono la vita; della specificità e selettività delle reazioni; dell'adattabilità e ridondanza (anaplerosi) delle vie metaboliche; della complessità dei processi biochimici; delle alterazioni che determinano l'insorgenza di alcune parologie.
A tal fine, la maggior parte degli sforzi saranno profusi affichè lo studente acqusisca la conoscenza profonda della graduale complessità delle biomolecole: dagli elementi base ai sistemi complessi, nonchè alle funzioni che essi sottendono.
La capacità di applicare queste conoscenze sarà testata durante le fasi interattive delle lezioni in cui gli studenti sono portati a rispondere a quesiti, e spinti a trovare connessioni e soluzioni a problemi biochimici correlati a patologie umane. In queste occasioni, sarà alimentata la capacità di giudizio, nonchè quella di argomentare e discutere su processi conosciuti o non chiari. Obiettivo di questo corso è, infatti, anche quello di sviluppare le capicità comunicative (linguistiche e di nomenclatura) e di apprendimento.

OBIETTIVI FORMATIVI:
Fornire le basi teoriche per capire ed implementare, con coscienza critica, le principali metodologie statistiche e probabilistiche utilizzate in Bioinformatica.

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE: acquisizione di conoscenze di calcolo delle probabilità ed inferenza statistica e comprensione dei problemi e delle tematiche proprie di queste discipline

CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE: l'acquisizione della capacità di applicare le conoscenze impartite nel corso delle lezioni frontali verrà sviluppata nel corso di esercitazioni pratiche utilizzando il software statistico R.

AUTONOMIA DI GIUDIZIO: sviluppo delle competenze necessarie a definire un'autonomia di giudizio circa i metodi statistici di base

ABILITÀ COMUNICATIVE: sviluppo di capacità di comunicazione delle tematiche proprie della probbailità e della biostatistica

CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO: sviluppo delle capacità di apprendimento di conoscenze di probabilità ed inferenza attraverso le lezioni, le esercitazioni pratiche, i libri di testo, il materiale didattico a disposizione e la letteratura scientifica

OBIETTIVI FORMATIVI: acquisizione delle conoscenze della bioinformatica di base: concetti, banche dati (sequenze nucleotidiche e proteiche, motivi funzionali, strutture 3D, letteratura scientifica), algoritmi della bioinformatica (ricerca di sequenze simili con metodi esaustivi ed euristici)

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE: acquisizione di conoscenze di bioinformatica di base e comprensione dei problemi e delle tematiche proprie della disciplina

CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE: l'acquisizione della capacità di applicare le conoscenze impartite nel corso delle lezioni frontali verrà sviluppata nel corso di esercitazioni pratiche di laboratorio

AUTONOMIA DI GIUDIZIO: sviluppo delle competenze necessarie a definire un'autonomia di giudizio

ABILITÀ COMUNICATIVE: sviluppo di capacità di comunicazione delle tematiche proprie della bioinformatica

CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO: sviluppo delle capacità di apprendimento di conoscenze bioinformatiche attraverso le lezioni, le esercitazioni pratiche, i libri di testo e la leteratura scientifica di argomento bioinformatico

OBIETTIVI FORMATIVI: acquisizione delle conoscenze della bioinformatica di base: concetti, banche dati (sequenze nucleotidiche e proteiche, motivi funzionali, strutture 3D, letteratura scientifica), algoritmi della bioinformatica (ricerca di sequenze simili con metodi esaustivi ed euristici)

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE: acquisizione di conoscenze di bioinformatica di base e comprensione dei problemi e delle tematiche proprie della disciplina

CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE: l'acquisizione della capacità di applicare le conoscenze impartite nel corso delle lezioni frontali verrà sviluppata nel corso di esercitazioni pratiche di laboratorio

AUTONOMIA DI GIUDIZIO: sviluppo delle competenze necessarie a definire un'autonomia di giudizio

ABILITÀ COMUNICATIVE: sviluppo di capacità di comunicazione delle tematiche proprie della bioinformatica

CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO: sviluppo delle capacità di apprendimento di conoscenze bioinformatiche attraverso le lezioni, le esercitazioni pratiche, i libri di testo e la leteratura

OBIETTIVI FORMATIVI:
Gli obiettivi del corso di Chimica Generale sono quelli di fornire allo studente una solida base teorica e descrittiva della chimica con cui affrontare i corsi successivi necessari alla formazione culturale di un biotecnologo. Lo studente dovra' essere in grado di risolvere problemi numerici e di applicare concetti di chimica di base.

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE:
Acquisire una solida comprensione della moderna teoria della struttura atomica e dei fenomeni a livello di scala atomica; comprendere le proprietà periodiche degli elementi, conoscere gli aspetti introduttivi alle moderne teorie del legame chimico e le loro implicazioni su struttura e proprieta' delle molecole, comprendere il formalismo ed il linguaggio della chimica, riconoscere varie tipologie di reazioni chimiche (scambio protonico, scambio elettronico, dissociazione elettrolitica, reazioni di precipitazione), comprendere le implicazioni quantitative di formule ed equazioni chimiche, anche in soluzione, usare l'equazione di stato dei gas anche per calcolare densità e pesi molecolari di specie gassose, utilizzare l'equazione di stato dei gas nei calcoli stechiometrici di reazioni che coinvolgono reagenti e/o prodotti gassosi, risolvere problemi di equilibri chimici, conoscere le definizioni di acido e di base secondo Arrhenius, Broensted e Lewis individuando le coppie acido-base coniugate, risolvere problemi di calcolo di pH e pOH di soluzioni acquose di acidi e basi forti e deboli, di soluzioni tampone, descrivere l'idrolisi salina e la preparazione di soluzioni tampone, utilizzare il prodotto di solubilità per calcolare concentrazioni di ioni in soluzione, anche in presenza di ione a comune.
Comprendere e prevedere la variazione delle proprietà delle soluzioni per effetto del solvente e le implicazioni pratiche delle proprietà colligative; conoscere le varie forme di energia e il ruolo da esse svolto nei processi fisici e nelle reazioni chimiche; discutere l'entropia e la seconda legge della Termodinamica; definire l'energia libera e la sua relazione con l'equilibrio; prevedere l'effetto della temperatura su un equilibrio chimico; disegnare una cella galvanica, identificando l'anodo e il catodo; scrivere le semireazioni che avvengono agli elettrodi e calcolare la forza elettromotrice tramite l'equazione di Nernst.

CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE:
Lo studente dovrà dimostrare di 1) comprendere i trend dei fenomeni chimici trattati nel Corso nonché 2) fare previsioni quantitative delle variabili che definiscono un sistema chimico.

AUTONOMIA DI GIUDIZIO:
La capacità critica che lo studente deve acquisire con la "palestra" del Corso di Chimica Generale serve come approccio scientifico da ritenersi funzionalmente utile per qualsiasi disciplina del Corso di Studi, ovvero come approccio metodologico per il prosieguo degli studi e della successiva carriera lavorativa in ambito biotecnologico.
Lo studente deve essere quindi in grado di capire autonomamente se i risultati di un calcolo o di un ragionamento siano numericamente e logicamente consistenti. Lo studente deve anche imparare, pertanto, a riconoscere la fondatezza di un ragionamento logico e, in particolare, scientifico.

ABILITÀ COMUNICATIVE:
Lo studente deve imparare a produrre elaborati scritti impostandone le premesse, sviluppando i calcoli e/o i ragionamenti, per pervenire alle conclusioni con rigore logico e/o matematico. Il formalismo chimico deve essere padroneggiato e usato correttamente.

CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO:
Lo studente dovrà essere in grado di apprendere le conoscenze e le competenze delle discipline chimiche dei corsi successivi, in particolare di Chimica Organica e Biochimica.

OBIETTIVI FORMATIVI: con questo corso fondamentale si vogliono fornire allo studente le basi della conoscenza della biologia. Citologia: Acquisizione di competenze relative all'osservazione delle cellule, con comprensione dei meccanismi legati alla sopravvivenza cellulare e alle interazioni con l'ambiente. Istologia: acquisizione della capacita di discriminare i vari tessuti e comprenderne le funzioni nell'organismo.
Embriologia: Conseguimento delle nozioni fondamentali di embriologia classica.

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE: lo studente deve aver assunto a fine corso la capacità di capire e studiare gli argomenti in modo autonomo. Gli si richiede dunque capacità di ripetere concetti e processi ma soprattutto di averli capiti. Nella prima parte del corso è richiesta invece una buona capacità descrittiva.

CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE: lo studente deve essere in grado di dimostrare di essere in grado di mettere in pratica quanto appreso, sia in modo applicativo che di dimostrazione di padronanza di comprensione. Lo studente deve essere in grado di sostenere argomentazioni e risolvere problemi nel campo della biologia.

AUTONOMIA DI GIUDIZIO: lo studente dovrà essere in grado di raccogliere e capire i dati per essere in grado di formulare giudizi autonomi. Allo studente si chiede di motivare gli strumenti utilizzati o di giustificarli per il fine sperimentale. Si chiede inoltre
di valutare la correttezza, l’ efficacia, la coerenza della parte sperimentale illustrata.

ABILITÀ COMUNICATIVE: lo studente dovrà esercitarsi ed acquisire buone capacità comunicative, con grande enfasi nell'acquisizione e l'utilizzo competente di un linguaggio specifico, preciso e professionale. Questo aspetto è di estrema importanza anche per imparare a comunicare e farsi capire da interlocutori non professionisti.

CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO: lo studente dovrà aver acquisito quelle capacità di apprendimento necessarie per proseguire ed approfondire lo studio in modo autonomo.
Quindi, lo studente deve sapere come leggere e comprendere le pubblicazioni scientifiche, sapere come selezionare e correlare argomenti e, molto importante, sapere come fare domande.

OBIETTIVI FORMATIVI: con questo corso fondamentale si vogliono fornire allo studente le basi della conoscenza della biologia. Citologia: Acquisizione di competenze relative all'osservazione delle cellule, con comprensione dei meccanismi legati alla sopravvivenza cellulare e alle interazioni con l'ambiente. Istologia: acquisizione della capacita di discriminare i vari tessuti e comprenderne le funzioni nell'organismo.
Embriologia: Conseguimento delle nozioni fondamentali di embriologia classica.

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE: lo studente deve aver assunto a fine corso la capacità di capire e studiare gli argomenti in modo autonomo. Gli si richiede dunque capacità di ripetere concetti e processi ma soprattutto di averli capiti. Nella prima parte del corso è richiesta invece una buona capacità descrittiva.

CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE: lo studente deve essere in grado di dimostrare di essere in grado di mettere in pratica quanto appreso, sia in modo applicativo che di dimostrazione di padronanza di comprensione. Lo studente deve essere in grado di sostenere argomentazioni e risolvere problemi nel campo della biologia.

AUTONOMIA DI GIUDIZIO: lo studente dovrà essere in grado di raccogliere e capire i dati per essere in grado di formulare giudizi autonomi. Allo studente si chiede di motivare gli strumenti utilizzati o di giustificarli per il fine sperimentale. Si chiede inoltre
di valutare la correttezza, l’ efficacia, la coerenza della parte sperimentale illustrata.

ABILITÀ COMUNICATIVE: lo studente dovrà esercitarsi ed acquisire buone capacità comunicative, con grande enfasi nell'acquisizione e l'utilizzo competente di un linguaggio specifico, preciso e professionale. Questo aspetto è di estrema importanza anche per imparare a comunicare e farsi capire da interlocutori non professionisti.

CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO: lo studente dovrà aver acquisito quelle capacità di apprendimento necessarie per proseguire ed approfondire lo studio in modo autonomo.
Quindi, lo studente deve sapere come leggere e comprendere le pubblicazioni scientifiche, sapere come selezionare e correlare argomenti e, molto importante, sapere come fare domande.

OBIETTIVI FORMATIVI:
Il corso si propone di fornire l'acquisizione dei principi terorici e applicativi della biologia sintetica e delle tecniche di bioimaging. Al termine el corso li studenti saranno in grado di
- riconoscere i diversi tipi di circuiti sintetici e tecniche di bioimaging per la loro validazione;
-ideare e realizzare progetti di biologia sintetica in vari mabiti applicati (biorimedio, biosensori, produzione di composti di interesse)
- comprenere gli approcci metodologici per la produzioen di celuel sintetiche e genomi minimi.

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE:
Acquisizione della capacità di apprendimento necessarie per la costruzione di circuiti sintetici e tecniche per la loro validazione e poter così continuare a studiare in modo autonomo ed elaborare e/o applicare idee originali in un contesto di ricerca.

CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE:
Capacità di applicare le conoscenze acquisite nello studio e nella realizzazione di progetti di biologia sintetici e di inseritle in contesti più ampi (o interdisciplinari) connessi al
settore di studio.

AUTONOMIA DI GIUDIZIO:
Capacità di integrare le conoscenze acquisite durante il corso di biolologia sintetica includendo riflessioni etiche. Capacità di applicare correttamente i tools della biologia sintetica a diversi ambiti della riecrca applicata e delle nuove scoperte scientifiche.

ABILITÀ COMUNICATIVE:
Capacità di presentare in modo chiaro e appropriato per terminologia e contenuti, di progetti di biologia sintetica, nonché delle conoscenze a essi sottese, a interlocutori specialisti e non specialisti.

OBIETTIVI FORMATIVI:

apprendere un linguaggio di programmazione
apprendere gli elementi dei metodi di analisi delle sequenze biologiche

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE:

elementi di programmazione con il linguaggio 'Ruby'
imparare a leggere interpretare e sviluppare semplice codice
per l'analisi di sequenze biologiche

CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE:

Gli studenti impareranno a risolvere semplici problemi in ambito
informatico e bioinformatico


AUTONOMIA DI GIUDIZIO:
Gli studenti acquisiranno la capacità di integrare le conoscenze e
gestire la complessità dei problemi
nonché di formulare giudizi sulla base di informazioni limitate o incomplete

ABILITÀ COMUNICATIVE:

Gli studenti impareranno a scrivere codice facilmente comprensibile ad altri
e facilmente modificabile

CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO:

Gli studenti acquisiranno le capacità necessarie ad apprendere da soli
nuovi linguaggi di programmazione e nuove funzionalità del linguaggio Ruby.

OBIETTIVI FORMATIVI: con questo corso fondamentale si vogliono fornire allo studente le basi della conoscenza della biologia. Citologia: Acquisizione di competenze relative all'osservazione delle cellule, con comprensione dei meccanismi legati alla sopravvivenza cellulare e alle interazioni con l'ambiente. Istologia: acquisizione della capacita di discriminare i vari tessuti e comprenderne le funzioni nell'organismo.
Embriologia: Conseguimento delle nozioni fondamentali di embriologia classica.

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE: lo studente deve aver assunto a fine corso la capacità di capire e studiare gli argomenti in modo autonomo. Gli si richiede dunque capacità di ripetere concetti e processi ma soprattutto di averli capiti. Nella prima parte del corso è richiesta invece una buona capacità descrittiva.

CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE: lo studente deve essere in grado di dimostrare di essere in grado di mettere in pratica quanto appreso, sia in modo applicativo che di dimostrazione di padronanza di comprensione. Lo studente deve essere in grado di sostenere argomentazioni e risolvere problemi nel campo della biologia.

AUTONOMIA DI GIUDIZIO: lo studente dovrà essere in grado di raccogliere e capire i dati per essere in grado di formulare giudizi autonomi. Allo studente si chiede di motivare gli strumenti utilizzati o di giustificarli per il fine sperimentale. Si chiede inoltre
di valutare la correttezza, l’ efficacia, la coerenza della parte sperimentale illustrata.

ABILITÀ COMUNICATIVE: lo studente dovrà esercitarsi ed acquisire buone capacità comunicative, con grande enfasi nell'acquisizione e l'utilizzo competente di un linguaggio specifico, preciso e professionale. Questo aspetto è di estrema importanza anche per imparare a comunicare e farsi capire da interlocutori non professionisti.

CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO: lo studente dovrà aver acquisito quelle capacità di apprendimento necessarie per proseguire ed approfondire lo studio in modo autonomo.
Quindi, lo studente deve sapere come leggere e comprendere le pubblicazioni scientifiche, sapere come selezionare e correlare argomenti e, molto importante, sapere come fare domande.

OBIETTIVI FORMATIVI: con questo corso fondamentale si vogliono fornire allo studente le basi della conoscenza della biologia. Citologia: Acquisizione di competenze relative all'osservazione delle cellule, con comprensione dei meccanismi legati alla sopravvivenza cellulare e alle interazioni con l'ambiente. Istologia: acquisizione della capacita di discriminare i vari tessuti e comprenderne le funzioni nell'organismo.
Embriologia: Conseguimento delle nozioni fondamentali di embriologia classica.

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE: lo studente deve aver assunto a fine corso la capacità di capire e studiare gli argomenti in modo autonomo. Gli si richiede dunque capacità di ripetere concetti e processi ma soprattutto di averli capiti. Nella prima parte del corso è richiesta invece una buona capacità descrittiva.

CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE: lo studente deve essere in grado di dimostrare di essere in grado di mettere in pratica quanto appreso, sia in modo applicativo che di dimostrazione di padronanza di comprensione. Lo studente deve essere in grado di sostenere argomentazioni e risolvere problemi nel campo della biologia.

AUTONOMIA DI GIUDIZIO: lo studente dovrà essere in grado di raccogliere e capire i dati per essere in grado di formulare giudizi autonomi. Allo studente si chiede di motivare gli strumenti utilizzati o di giustificarli per il fine sperimentale. Si chiede inoltre
di valutare la correttezza, l’ efficacia, la coerenza della parte sperimentale illustrata.

ABILITÀ COMUNICATIVE: lo studente dovrà esercitarsi ed acquisire buone capacità comunicative, con grande enfasi nell'acquisizione e l'utilizzo competente di un linguaggio specifico, preciso e professionale. Questo aspetto è di estrema importanza anche per imparare a comunicare e farsi capire da interlocutori non professionisti.

CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO: lo studente dovrà aver acquisito quelle capacità di apprendimento necessarie per proseguire ed approfondire lo studio in modo autonomo.
Quindi, lo studente deve sapere come leggere e comprendere le pubblicazioni scientifiche, sapere come selezionare e correlare argomenti e, molto importante, sapere come fare domande.

OBIETTIVI FORMATIVI: acquisizione delle conoscenze della bioinformatica di base: concetti, banche dati (sequenze nucleotidiche e proteiche, motivi funzionali, strutture 3D, letteratura scientifica), algoritmi della bioinformatica (ricerca di sequenze simili con metodi esaustivi ed euristici)

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE: acquisizione di conoscenze di bioinformatica di base e comprensione dei problemi e delle tematiche proprie della disciplina

CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE: l'acquisizione della capacità di applicare le conoscenze impartite nel corso delle lezioni frontali verrà sviluppata nel corso di esercitazioni pratiche di laboratorio

AUTONOMIA DI GIUDIZIO: sviluppo delle competenze necessarie a definire un'autonomia di giudizio

ABILITÀ COMUNICATIVE: sviluppo di capacità di comunicazione delle tematiche proprie della bioinformatica

CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO: sviluppo delle capacità di apprendimento di conoscenze bioinformatiche attraverso le lezioni, le esercitazioni pratiche, i libri di testo e la leteratura scientifica di argomento bioinformatico

OBIETTIVI FORMATIVI: acquisizione delle conoscenze della bioinformatica di base: concetti, banche dati (sequenze nucleotidiche e proteiche, motivi funzionali, strutture 3D, letteratura scientifica), algoritmi della bioinformatica (ricerca di sequenze simili con metodi esaustivi ed euristici)

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE: acquisizione di conoscenze di bioinformatica di base e comprensione dei problemi e delle tematiche proprie della disciplina

CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE: l'acquisizione della capacità di applicare le conoscenze impartite nel corso delle lezioni frontali verrà sviluppata nel corso di esercitazioni pratiche di laboratorio

AUTONOMIA DI GIUDIZIO: sviluppo delle competenze necessarie a definire un'autonomia di giudizio

ABILITÀ COMUNICATIVE: sviluppo di capacità di comunicazione delle tematiche proprie della bioinformatica

CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO: sviluppo delle capacità di apprendimento di conoscenze bioinformatiche attraverso le lezioni, le esercitazioni pratiche, i libri di testo e la leteratura scientifica di argomento bioinformatico

OBIETTIVI FORMATIVI:
Si richiede allo studente la conoscenza dell’architettura e della morfologia delle macromolecole biologiche. La conoscenza delle banche dati delle macromolecole, delle tecniche di simulazione e dei programmi utilizzati per la rappresentazione, l’analisi e la predizione strutturale delle biomolecole.

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE:
Si richiede allo studente la capacità di applicare le conoscenze acquisite sulle tecniche di simulazione delle macromolecole alla comprensione di problemi strutturali. Si richiede inoltre l’abilità nel risolvere problemi strutturali di base ma anche la capacità di individuare quelli inusuali o complessi, la capacità interpretativa per la loro risoluzione, anche in contesti multidisciplinari e sperimentali ma legati ad una componente molecolare.

CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE:
Gli studenti devono dimostrare conoscenze e capacità di comprensione strutturale che estendono e rafforzano quelle di base che sono generalmente associate al primo corso di Laurea conseguito e che consentono di elaborare e di applicare le moderne metodologie di simulazione anche in assistenza ad un contesto di ricerca sperimentale.

AUTONOMIA DI GIUDIZIO:
Gli studenti devono dimostrare la capacità di integrare le conoscenze strutturali e le tecniche simulative al fine di gestire la complessità molecolare e di formulare giudizi e di ipotizzare azioni per la loro risoluzione, sulla base di informazioni limitate o incomplete, includendo una riflessione sulle soggettività del giudizio dell’operatore o sui limiti della tecnica o del programma utilizzato per raggiungere lo scopo.

ABILITÀ COMUNICATIVE:
Gli studenti devono saper descrivere in modo chiaro e privo di ambiguità le tecniche di simulazione acquisite, devono utilizzare un linguaggio scientifico adeguato e consono alla materia impiegando termini specialistici e di chiara validità tecnico-scientifica. La capacità comunicativa si deve estendere alla possibilità d’interlocuzione con specialisti o non specialisti del settore.

CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO:
Gli studenti devono sviluppare una capacità di apprendimento, basata sulla comprensione delle tecniche di base, che consenta loro uno studio autonomo di avanzate metodiche di simulazione elaborate nel settore e continuamente emergenti nel panorama della bioinformatica strutturale.

Conoscere ed approfondire gli approcci sperimentali e gli strumenti bioinformatici utili per l’ ottenimento e l’analisi dei dati genetici dei procarioti e dei loro virus. Nello specifico, l’ obiettivo del corso è quello di fornire una panoramica degli approcci di Next Generation Sequencing (NGS) utilizzati per l’analisi dei microrganismi e di presentare una serie di strumenti di bioinformatica utili per l’ analisi di questo tipo di dati.

Sviluppo di protocolli diagnostici-terapeutici di modelli di malattia.
Acquisire competenze nella progettazione di studi preclinici e clinici di fase precoce su biomarcatori, farmaci e sistemi biomolecolari in grado di favorire una tempestiva e precisa diagnosi e portare a trattamenti terapeutici personalizzati.

La prova finale, consiste nella preparazione e discussione pubblica di un'ampia relazione scritta, frutto di una originale e autonoma elaborazione dello studente nel settore da lui prescelto e derivante da una congrua attività sperimentale in laboratorio, su un argomento attuale di ricerca proposto dal docente relatore della tesi. La discussione avviene in seduta pubblica davanti ad una commissione di docenti che verificherà la capacità dello studente di progettare, sperimentare ed analizzare i risultati finali in maniera autonoma e la possibilità di presentare e di discutere
chiaramente i risultati ottenuti.

Elaborazione e sviluppo di un argomento di ricerca originale proposto dal relatore della tesi. Gli studenti potranno effettuare il tirocinio presso lo stesso Ateneo o presso un ente di ricerca esterno italiano o straniero o presso una azienda, per una numero di ore equivalente a 46 CFU per il curriculum Informatico e 43 CFU per il curriculum Biomedico.

OBIETTIVI FORMATIVI:
L'obiettivo del corso è insegnarvi a lavorare con gli strumenti del mestiere in python, a
partire dallo sfruttare le peculiarità del linguaggio, all'organizzazione del codice fino alle
librerie per il machine learning e la visualizzazione dei risultati.
CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE:
Utilizzo di strumenti avanzati tipici del python.
AUTONOMIA DI GIUDIZIO:
Capacità di valutare una soluzione di un problema informatico nel contesto del tipo di
applicazione necessaria
ABILITÀ COMUNICATIVE:
Saper comunicare i proprio risultati tramite l'utilizzo di plot

OBIETTIVI FORMATIVI: Obiettivo di questo corso è di mettere gli studenti in condizione di creare applicazioni web originali relative ai loro interessi ed attivita di ricerca in campo biologico e biomedico al fine di poter rendere fruibili alla comunità scientifica, attraverso la rete, i risultati delle proprie ricerche presenti e future.

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE: gli studenti dovranno conseguire una comprensione approfondita ed operativa del funzionamento della rete Internet e dei relativi protocolli e strumenti di sviluppo

CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE: le conoscenze acquisite dovranno avere valenza operativa. Ovvero gli studenti dovranno non solo capire i fondamenti teorici del funzionamento delle reti e della programmazione web, ma anche essere in grado di applicare tali conoscenze allo sviluppo diretto di siti ed applicazioni web originali.

AUTONOMIA DI GIUDIZIO: Imparare a sviluppare applicazioni web in maniera autonoma aiuterà gli studenti ad essere in grado di valutare in maniera professionale pubblicazioni e applicazioni sviluppate da altri, accrescendo dunque la loro maturità scientifica e rendendoli attori autonomi e dotati di capacità di critica nel complesso mondo della Scienza e del lavoro legato ad attività scientifiche di alto livello al quale si avviano a far parte attravero lo studio delle varie discipline che concorrono a definire la Bioinformatica nel senso più ampio del termine.

ABILITÀ COMUNICATIVE: durante il corso viene sviluppato un dialogo costante con gli studenti ai quali si richiede di essere in grado di esporre, lezione dopo lezione, in maniera articolata gli argomenti appresi. Tale dialogo è facilitato dal numero relativamente contenuto degli studenti che afferiscono alla laurea, e vede gli studenti non come meri ricettori di una comunicazione effettuata dal docente, ma al contrario come costanti protagonisti di uno scambio anche verbale, che aiuta senz’altro lo sviluppo delle loro abilità comunicative.


CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO: Contrariamente alla laurea triennale, nella laurea magistrale si richiede una maggiore capacità di sviluppare una capacità di apprendimento individuale in cui lo studente può e deve seguire un percorso di apprendimento personalizzato in cui oltre ad assimilare quanto spiegato durante le lezioni, porta ad approfondimenti di tipo individuale su argomenti di particolare interesse. Questo aspetto viene messo in particolare rilievo nel presente corso, nel quale viene ripetutamente ricordato agli studenti che quanto insegnato non costituisce il corpo di conoscenze finale da possedere, ma piuttosto una solida base per un apprendimento di tipo individuale nel quale gli studenti possono e devono approfondire determintate tematiche seguendo i loro interessi. Il corso si presta particolarmente a questo tipo di approccio in quanto su ogni singolo argomento esiste una abbondanza di informazioni reperibili in rete che lo consentono. Il testo online di base fornito dal docente è ricco di tali spunti, rimandando continuamente ad altre fonti attraverso dei links presenti nel testo.

OBIETTIVI FORMATIVI:
Fornire le basi teoriche per capire ed implementare, con coscienza critica, le principali metodologie statistiche e probabilistiche utilizzate in Bioinformatica.

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE: acquisizione di conoscenze di calcolo delle probabilità ed inferenza statistica e comprensione dei problemi e delle tematiche proprie di queste discipline

CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE: l'acquisizione della capacità di applicare le conoscenze impartite nel corso delle lezioni frontali verrà sviluppata nel corso di esercitazioni pratiche utilizzando il software statistico R.

AUTONOMIA DI GIUDIZIO: sviluppo delle competenze necessarie a definire un'autonomia di giudizio circa i metodi statistici di base

ABILITÀ COMUNICATIVE: sviluppo di capacità di comunicazione delle tematiche proprie della probbailità e della biostatistica

CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO: sviluppo delle capacità di apprendimento di conoscenze di probabilità ed inferenza attraverso le lezioni, le esercitazioni pratiche, i libri di testo, il materiale didattico a disposizione e la letteratura scientifica

OBIETTIVI FORMATIVI:
Conoscere ed approfondire gli approcci sperimentali e gli strumenti bioinformatici utili per l’ ottenimento e l'analisi dei dati genetici dei procarioti e dei loro virus. Nello specifico, l’ obiettivo del corso è quello di fornire una panoramica degli approcci di Next Generation Sequencing (NGS) utilizzati per l’analisi dei microrganismi e di presentare una serie di strumenti di bioinformatica utili per l’ analisi di questo tipo di dati.

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE:
Al termine del corso gli studenti devono possedere basi solide nell'ambito della genetica e della bioinformatica dei microrganismi e anche familiarità con i metodi analitici in modo da poter analizzare in maniera approfondita dati genetici di microrganismi e loro virus.
A tal fine è necessario che lo studente sia padrone dei seguenti campi:
- genetica dei procarioti e dei loro virus e delle principali differenze con la genetica eucariotica;
- nozioni fondamentali degli algoritmi comunemente usati per analisi di dati NGS;
- conoscenza dei principali software utili per analisi genetiche di dati NGS relativi a microrganismi e loro virus;
Gli strumenti didattici principali utilizzati per l'insegnamento del corso sono lezioni frontali ed esercitazioni pratiche in aula.
La verifica del raggiungimento dell'obiettivo formativo è ottenuta mediante esame scritto effettuato al termine del corso ed eventualmente prove in itinere intese a rilevare la preparazione degli studenti e l'efficacia dei processi di insegnamento.

CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE:
Al termine del corso lo studente deve saper applicare le conoscenze acquisite per:
- saper scegliere la strategia o le strategie sperimentali più idonee per lo studio di un particolare microrganismo o di un batteriofago
- valutare la qualità dei dati grezzi ottenuti da un sequenziamento effettuato con tecnologie di tipo NGS
- saper scegliere ed utilizzare gli approcci analitici più idonei per l'analisi di dati NGS
- conoscere e saper interrogare i database disponibili in rete utili per l'analisi di genomi di microrganismi e di virus procariotici
- conoscere e saper utilizzare i software stand-alone maggiormente utilizzati per la genetica dei microrganismi

AUTONOMIA DI GIUDIZIO:
Lo studente saprà:
- interrogare e gestire l'output ottenuto da database di pubblico dominio accessibili tramite la rete internet
- analizzare approfonditamente singoli genomi batterici ed essere in grado di rilevare differenze biologiche salienti con altri membri appartenenti alla stessa specie od a specie simili
-saper gestire ed analizzare tramite metodiche semi-automatiche gruppi di genomi batterici o di batteriofagi
ABILITÀ COMUNICATIVE:
Al termine del corso in Genetica e Bioinformatica dei Microrganismi lo studente avrà maturato una buona capacità di lavorare di gruppo, maturata soprattutto grazie alle attività pratiche di laboratorio e, al contempo, saprà anche lavorare autonomamente.
Nello specifico:
- sarà in grado di formulare idee e soluzioni pratiche nell'ambito della
bioinformatica dei microrganismi
- sarà in grado di comunicare con diverse figure professionali quali biologi ed informatici
- sarà capace di inserirsi in gruppi di lavoro e di operare all'interno di essi con definiti gradi di autonomia.
Le abilità comunicative saranno sviluppate attraverso l'incoraggiamento alla discussione e interazione durante le attività pratiche di laboratorio.

CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO:
Lo studente che abbia terminato con profitto il corso sarà in grado di:
- sapersi integrare con facilità e profitto in gruppi di lavoro costituiti da bioinformatici, genetisti o biologi e raggiungere un buon livello di produttività in tempi rapidi;
- approfondire le tematiche trattate durante il corso a livello di master di primo livello, centrati su tematiche bioinformatiche, informatiche e biologiche con un alto grado d'autonomia.

OBIETTIVI FORMATIVI:

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE: acquisire capacità di comprensione e abilità nel risolvere problemi e tematiche nuove o non familiari, inserite in contesti più ampi (o interdisciplinari) connessi al proprio settore di studio


CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE: rafforzamento delle capacita' acquisite durante il corso triennale


AUTONOMIA DI GIUDIZIO: acquisire capacità di integrare le conoscenze e gestire la complessità, nonché di formulare giudizi sulla base di informazioni limitate o incomplete, includendo la riflessione sulle responsabilità sociali e etiche collegate all’applicazione delle loro conoscenze e dei loro giudizi


ABILITÀ COMUNICATIVE: acquisire la capacita' di comunicare in modo chiaro e privo di ambiguità le proprie conclusioni, nonché le conoscenze a esso sottese, a interlocutori specialisti e non specialisti

OBIETTIVI FORMATIVI: Il corso ha l’ obiettivo di introdurre gli studenti alla complessità e plasticità del proteoma e di fornirgli un insieme di conoscenze teoriche utili a comprendere le principali metodiche utilizzate per l'identificazione e caratterizzazione delle proteine su scala proteomica

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE: Al termine dell’'insegnamento, lo studente avrà acquisito le conoscenze necessarie a comprendere le diverse metodologie sperimentali con cui è possibile analizzare miscele molto complesse di proteine (proteomi) e la comprensione delle potenzialità innovative offerte da questi approcci per affrontare una moltitudine di problemi di grande rilevanza nella ricerca biologica

CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE: Oltre a fornire le nozioni necessarie a comprendere le basi sperimentali della proteomica e delle sue applicazioni alla ricerca biologica, l'insegnamento punto a fornire allo studente di bioinformatica la piena consapevolezza di poter applicare le sue peculiare competenze alla gestione ed elaborazione dei dati complessi generati negli esperimenti di proteomica.

AUTONOMIA DI GIUDIZIO: Lo studente deve dimostrare di aver acquisito la capacità di valutare autonomamente lavori scientifici in cui si affrontano problemi biologici mediante approcci proteomici e valutare se i metodi usati e i risultati ottenuti siano coerenti con le conclusioni riportate

ABILITÀ COMUNICATIVE: Lo studente dovrà dimostrarsi capace di divulgare dati sperimentali ottenuti dalla lettura critica di pubblicazioni scientifiche, in forma orale e con l'ausilio di materiale multimediale, utilizzando un linguaggio scientifico chiaro ed appropriato. Inoltre, in sede di esame, lo studente dovrà essere in grado di esporre in forma chiara, approfondita e con la corretta terminologia scientifica i temi relativi ai principali argomenti svolti.

CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO: Oltre ad acquisire le conoscenze specifiche proposte dal docente, obiettivo del corso è anche quello di sviluppare la capacità dello studente di fare deduzioni logiche basate sui concetti acquisiti, usarli in situazioni diverse e fare collegamenti tra gli stessi.

OBIETTIVI FORMATIVI:
Il corso si propone di fornire l'acquisizione dei principi terorici e applicativi della biologia sintetica e delle tecniche di bioimaging. Al termine el corso li studenti saranno in grado di
- riconoscere i diversi tipi di circuiti sintetici e tecniche di bioimaging per la loro validazione;
-ideare e realizzare progetti di biologia sintetica in vari mabiti applicati (biorimedio, biosensori, produzione di composti di interesse)
- comprenere gli approcci metodologici per la produzioen di celuel sintetiche e genomi minimi.

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE:
Acquisizione della capacità di apprendimento necessarie per la costruzione di circuiti sintetici e tecniche per la loro validazione e poter così continuare a studiare in modo autonomo ed elaborare e/o applicare idee originali in un contesto di ricerca.

CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE:
Capacità di applicare le conoscenze acquisite nello studio e nella realizzazione di progetti di biologia sintetici e di inseritle in contesti più ampi (o interdisciplinari) connessi al
settore di studio.

AUTONOMIA DI GIUDIZIO:
Capacità di integrare le conoscenze acquisite durante il corso di biolologia sintetica includendo riflessioni etiche. Capacità di applicare correttamente i tools della biologia sintetica a diversi ambiti della riecrca applicata e delle nuove scoperte scientifiche.

ABILITÀ COMUNICATIVE:
Capacità di presentare in modo chiaro e appropriato per terminologia e contenuti, di progetti di biologia sintetica, nonché delle conoscenze a essi sottese, a interlocutori specialisti e non specialisti.

OBIETTIVI FORMATIVI:

apprendere un linguaggio di programmazione
apprendere gli elementi dei metodi di analisi delle sequenze biologiche

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE:

elementi di programmazione con il linguaggio 'Ruby'
imparare a leggere interpretare e sviluppare semplice codice
per l'analisi di sequenze biologiche

CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE:

Gli studenti impareranno a risolvere semplici problemi in ambito
informatico e bioinformatico


AUTONOMIA DI GIUDIZIO:
Gli studenti acquisiranno la capacità di integrare le conoscenze e
gestire la complessità dei problemi
nonché di formulare giudizi sulla base di informazioni limitate o incomplete

ABILITÀ COMUNICATIVE:

Gli studenti impareranno a scrivere codice facilmente comprensibile ad altri
e facilmente modificabile

CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO:

Gli studenti acquisiranno le capacità necessarie ad apprendere da soli
nuovi linguaggi di programmazione e nuove funzionalità del linguaggio Ruby.

OBIETTIVI FORMATIVI:
Si richiede allo studente la conoscenza dell’architettura e della morfologia delle macromolecole biologiche. La conoscenza delle banche dati delle macromolecole, delle tecniche di simulazione e dei programmi utilizzati per la rappresentazione, l’analisi e la predizione strutturale delle biomolecole.

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE:
Si richiede allo studente la capacità di applicare le conoscenze acquisite sulle tecniche di simulazione delle macromolecole alla comprensione di problemi strutturali. Si richiede inoltre l’abilità nel risolvere problemi strutturali di base ma anche la capacità di individuare quelli inusuali o complessi, la capacità interpretativa per la loro risoluzione, anche in contesti multidisciplinari e sperimentali ma legati ad una componente molecolare.

CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE:
Gli studenti devono dimostrare conoscenze e capacità di comprensione strutturale che estendono e rafforzano quelle di base che sono generalmente associate al primo corso di Laurea conseguito e che consentono di elaborare e di applicare le moderne metodologie di simulazione anche in assistenza ad un contesto di ricerca sperimentale.

AUTONOMIA DI GIUDIZIO:
Gli studenti devono dimostrare la capacità di integrare le conoscenze strutturali e le tecniche simulative al fine di gestire la complessità molecolare e di formulare giudizi e di ipotizzare azioni per la loro risoluzione, sulla base di informazioni limitate o incomplete, includendo una riflessione sulle soggettività del giudizio dell’operatore o sui limiti della tecnica o del programma utilizzato per raggiungere lo scopo.

ABILITÀ COMUNICATIVE:
Gli studenti devono saper descrivere in modo chiaro e privo di ambiguità le tecniche di simulazione acquisite, devono utilizzare un linguaggio scientifico adeguato e consono alla materia impiegando termini specialistici e di chiara validità tecnico-scientifica. La capacità comunicativa si deve estendere alla possibilità d’interlocuzione con specialisti o non specialisti del settore.

CAPACITÀ DI APPRENDIMENTO:
Gli studenti devono sviluppare una capacità di apprendimento, basata sulla comprensione delle tecniche di base, che consenta loro uno studio autonomo di avanzate metodiche di simulazione elaborate nel settore e continuamente emergenti nel panorama della bioinformatica strutturale.

Conoscere l'algebra su cui si basa la teoria dei Database Relazionali. Imparare a progettare e a costruire un Database Relazionale. Utilizzare al meglio l' SQL.

Sviluppo di protocolli diagnostici-terapeutici di modelli di malattia.
Acquisire competenze nella progettazione di studi preclinici e clinici di fase precoce su biomarcatori, farmaci e sistemi biomolecolari in grado di favorire una tempestiva e precisa diagnosi e portare a trattamenti terapeutici personalizzati.

Elaborazione e sviluppo di un argomento di ricerca originale proposto dal relatore della tesi. Gli studenti potranno effettuare il tirocinio presso lo stesso Ateneo o presso un ente di ricerca esterno italiano o straniero o presso una azienda, per una numero di ore equivalente a 46 CFU per il curriculum Informatico e 43 CFU per il curriculum Biomedico.

La prova finale consiste nella preparazione e discussione pubblica di un'ampia relazione scritta, frutto di una originale e autonoma elaborazione dello studente nel settore da lui prescelto e derivante da una congrua attività sperimentale, su un argomento attuale di ricerca proposto dal docente relatore della tesi. La prova finale è strutturata in modo da permettere alla Commissione di Laurea di verificare il grado di maturità raggiunto dal candidato nell'organizzazione teorica del lavoro e la sua capacità di integrare tali conoscenze in ambito bioinformatico, nonché di valutarne le capacità espositive.